Sinopse:
O mundo azul, que simboliza a razão, está sob ataque constante por parte das criaturas chamadas Nightfly O'Note proveniente do Mundo Vermelho, simbolizando instinto. Akira Asagi, protagonista 17 anos, que é pesquisadora do Blue World, é nomeado para liderar a guerra em Ryuukyuu LAG, uma academia de defesa, orgulho nas ilhas de Ishigaki e Iriomote. Ela atende a sexta unidade de combate "IS", que se formou quatro anos após uma batalha feroz que aniquilou a quinta unidade. Akari deve levar estes seis pilotos, também chamados de Scared Rider Xechs, para lutar contra o outro mundo, enquanto, ao mesmo tempo aprofundar o relacionamento entre eles.